1.大气化学与气候团队（学科带头人：刘绍臣院士） 

主要研究大气化学、空气品质、稀有气体及气溶胶之收支平衡，生地化循环，气候变迁等。 

2.含碳组分大气环境行为及效应研究团队（学科带头人：邵敏）

团队主要研究内容：大气污染成因机制与防控研究，含碳组分来源及化学行为研究，臭氧化学机制和防控研究

3.光化学污染机理与控制团队（学科带头人：王伯光） 

围绕大气光化学污染及其生态环境影响科学问题，开展天然源（植物、土壤、水体）和人为源（工业、机动车、溶剂使用、垃圾填埋等）排放的挥发性有机物的精准测量技术、源解析方法、大气光化学行为与演化机理、生态环境效应、环境安全与健康评价及其污染防治对策等研究。 

4.区域空气质量与气候相互作用数值模拟团队 （学科带头人：王雪梅） 

团队主要研究方向： 

三维空气质量与气候变化数值模式的开发和应用 

城镇化对区域气候和空气质量的影响 

空气污染与天气气候的双向反馈机制 

陆面与大气相互作用的数值模拟研究